1984年初，联合国的一个调查小组发现，伊拉克违反《1925年日内瓦议定书》，在两伊战争中使用了化学武器，而且，在其用于研制化学武器的化学前体与原料中，至少有一部分来自合法的贸易渠道。有鉴于此，一些国家针对可能被用于制造化学武器的一些化学品实施了出口管制。
但这些管制措施缺乏协调一致性，而且，试图规避这些措施的企图很快昭然若揭。面对这种情况，澳大利亚建议实施出口管制的国家举行一次会议，以协调各国的出口许可措施并增进相互合作。于是，1985年6月，后来以“澳大利亚集团”著称于世的组织在布鲁塞尔举行了第一次会议。会上，15个与会国和欧洲委员会都同意：提高现有出口管制措施的成效、预防化学武器扩散是一项有价值的探索工作。
自此，澳大利亚集团定期召开会议。目前，集团的年会在巴黎举办。而集团所探讨的出口管制的范围已不断深化，以应对层出不穷的各种新威胁、新挑战。20世纪 90年代初，面对两用原料被转用于生物武器研制计划的相关证据，各参加国决定对特定的生物用品采取出口管制措施。澳大利亚集团所制定的出口管制清单也扩大了管制范围，将可用于制造或处理生化武器的技术和设备均涵盖在内。
澳大利亚集团参加国的数目已从1985年的19个扩大到了目前的42个，而欧洲委员会也是集团参与方。